В Отделе народов Урала с Музеем археологии и этнографии разрабатываются комплексные исследования этнической истории и этнокультурных взаимодействий тюркских, финно-угорских и восточнославянских народов Башкортостана и в целом Волго-Уральского региона. В течение всего периода существования Отдела составной его частью является Музей археологии и этнографии, в котором сосредоточены богатейшие собрания по всем периодам древнейшей, древней и средневековой истории Южного Урала, накоплены ценные и достаточно репрезентативные коллекции по культуре и быту народов края.
Выставки музея отражают новейшие представления о развитии народов и культур на территории Южного Урала с древнейших времен до позднего средневековья, в хронологии показывают эволюцию и смену различных культур и этнических образований. Завершают экспозицию 3 зала с яркими и самобытными материалами по этнографии башкир и народов РБ. Выставки и залы сопровождаются картами, схемами, планами, фотографиями, графическими реконструкциями, которые позволяют посетителям получить насыщенную и полноценную информацию.